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NOMBRE DEL CURSOFundamentos y Aplicaciones de la Bioinformática
NOMBRE DEL MODULOFUNDAMENTOS Y APLICACIONES DE BIOINFORMÁTICA
Nº CRÉDITOS EUROPEOS5 ECTS
COORDINADORArmando Blanco Morón
IDIOMAEspañol/Inglés
CARÁCTEROptativo
PROFESORADO
Armando Blanco Morón 2 ECTS
Coral del Val Muñoz 1 ECTS
David Alejandro Pelta 1 ECTS
Jorge Sergio Igor Zwir Nawrocki 1 ECTS
COMPETENCIAS
  •  Comprender la complejidad de los procesos biológicos.
  •  Conocer y comprender tanto el funcionamiento como la metodología empleada en el desarrollo de algunas de las herramientas más usuales.
  • Entender la modelización matemática de ciertos procesos biológicos.
  • Manipular los modelos previos mediante técnicas matemáticas y algorítmicas con el objeto de obtener indicios que permitan aumentar la comprensión sobre el proceso biológico subyacente.
  • Comprender la relación secuencia-estructura-función y las herramientas bioinformáticas que se pueden utilizar en cada momento.
  • Capacidad para el estudio y análisis de nuevas estrategias computacionales para la extracción de información de las ingentes cantidades de datos obtenidas de la biología.
  • Desarrollar habilidades para poder realizar críticas constructivas sobre artículos relacionados con la materia.
METODOLOGÍA DE ENSEÑANZA Y APRENDIZAJE
Actividades formativas y su relación con las competencias:
  • El sistema de clases es semi-presencial, por lo que se pretende el uso intensivo de los recursos de internet para mejorar y potenciar la calidad docente. Para ello profesores y alumnos disponen de un acceso identificado a través de esta web que permite la comunicación directa entre el profesor y el alumno, descarga de material, consultas diversas, foros, realización de encuestas, etc.
  • Las actividades serán consideradas en primer lugar desde una vertiente de carácter teórico, que servirá para que el alumno sitúe los problemas dentro de un marco más general, para pasar posteriormente a la presentación, estudio y resolución de casos prácticos.
  • Las clases teóricas presentarán los conceptos básicos y las principales relaciones entre ellos, dejando al alumno la búsqueda de relaciones más profundas y la relación de ejercicios que permitan calibrar el conocimiento de los conceptos.
  • Las clases prácticas se desarrollarán en aulas de informática utilizando material para ejercitar la identificación de problemas relacionados con las clases teóricas, encaminadas a fijar los conocimientos teóricos, de forma que les acerquen a la resolución de problemas reales.
  • Se intentará que las estrategias buscadas sean lo más genéricas posible, prestando especial atención a la interpretación de los resultados obtenidos.
- 4 horas de clases presenciales
- 4 horas de clases de trabajo práctico en laboratorio
- 17 horas de trabajo del alumno
CRITERIOS Y PROCEDIMIENTOS DE EVALUACIÓN
  • Evaluación continua y trabajo personal desarrollado por el alumno a lo largo del curso.
  • Si por razones justificadas, algún alumno no pudiera asistir al menos al 50% del curso, el alumno se pondrá en contacto por correo con los profesores de las sesiones a las que no haya asistido, y ponerse de acuerdo para realizar los trabajos que se le asignen.
  • Los alumnos que deseen en la convocatoria de Junio obtener una calificación alta, deberán contactar con algún profesor para concretar el trabajo que deben realizar.
  • Los alumnos que no hayan superado el curso y que deseen superarlo en Septiembre, deberán ponerse en contacto con al menos dos profesores del curso para realizar el trabajo que se les asigne. En el caso de que deseen optar a una calificación superior al aprobado en Septiembre, deberán realizar al menos tres trabajos.
TEMARIO DE TEORÍA
Elementos básicos de Bioinformática 1 ECTS
Bioinformática Estructural 1 ECTS
Microarrays. Aplicaciones 2 ECTS
Introducción a las Redes genéticas 1 ECTS
TEMARIO DE PRÁCTICAS
Las prácticas se realizarán mediante herramientas y base de datos disponibles a través de Internet.
BIBLIOGRAFÍA
  •  Setubal, Meidanis. Introduction to Computational Molecular Biology Ed. PWS Publishing Company 1997
  •  TK. Attwood D.J. Parry-Smith Introduction to Bioinformatics. Ed. Addison Wesley. 1999
  •  Daniel P. Berrar, Werner Dubitzky, Martin Granzow. A practical Approach to Microaaray Data Analysis. Ed. Kluwer Academic Publishers. 2003
  •  Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. R. Durbin, S. R. Eddy, A. Krogh, G. J. Mitchison. Cambridge University Press, 1998
  •  David W. Mount, Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, 2004
  •  Dan Gusfield . Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press. 1997
  •  Stephen Misener, Stephen A., Ph.D. Krawetz. Bioinformatics: Methods and Protocols. Humana Press. 2000
  •  Structural Bioinformatics (Methods of Biochemical Analysis, V. 44) by Philip E. Bourne (Editor), Helge Weissig (Editor) Editorial Wiley-Liss. 2003
Máster: Soft Computing y Sistemas Inteligentes
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E.T.S. Ingeniería Informática y de Telecomunicaciones
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